Sua população até 2010 era de 3.852 habitantes, sendo que a maior parte mora na zona rural.
Fundado em 16 de agosto de 1892, através da
Lei Estadual nº 59, teve sua cultura social e econômica proveniente principalmente
da agropecuária e do tropeirismo. Sua origem está, inclusive, ligada ao fato do
vilarejo ter sido passagem e pouso de tropeiros que vinham “das Minas Gerais”, vender
seus produtos em São José dos Campos.
O Distrito de São Francisco Xavier é uma área de
Proteção Ambiental Federal, Estadual e Municipal, embora hoje somente a APA
Estadual esteja regulamentada, com um Plano de Manejo e um Conselho Consultivo atuante.
Nas suas montanhas, brotam inúmeras nascentes que ajudam substancialmente a
compor as águas do Rio do Peixe, afluente do rio Paraíba do Sul, que por sua
vez contribui com o sistema do Jaguari, abastecendo São José dos Campos, o município
de São Paulo. O Rio Paraíba do Sul também abastece uma grande parcela da
Baixada Fluminense. A preservação de suas matas é, portanto, fundamental no
abastecimento de água de grandes centros urbanos.São Francisco Xavier é, ainda, área de existência de grupos de Muriqui, o “Brachyteles arachnoides”, maior primata das Américas, que corre risco de extinção. Suas matas abrigam animais como jaguatiricas, pacas, capivaras, esquilos, cobras, lagartos, diversas espécies de aves e de insetos.
